本校原為省立花蓮師範學校，創設於民國三十六年十月二十七日，首任校長為林范劍先生。初創時為縣府特撥花蓮市花岡山前成功中學為校址，除接收省立花蓮中學及省立花蓮女中附設簡易師範班外，並招收二年制及四年制簡易師範班各一班，初基始奠。三十八年七月，汪知亭先生接掌本校，銳意發展校務，並成立附屬小學，規模漸備。

四十年十月，花蓮遭逢大地震，校舍設備損失慘重，一時難以修復。四十二年八月，本校易長，許俊哲先生受任於百毀待復之際，致力整修校務，添補設備，學校現復舊觀。四十五年，李昇先生接掌本校。四十七年奉令增辦一年制特別師範科，招訓高中畢業有志青年；不意是年七月十五日，溫妮大颱風侵花，校舍全毀，修復匪易，因作遷校計畫。四十八年六月奉准遷至美倫七星潭現址，七月動工興建新校舍。十二月奉令代辦退除役官兵轉國校師資訊練班。四十九年九月完成遷校，黌舍面山背海，巍然壯觀。

五十三年七月，本校奉令改制為師範專科學校，戴行悌先生任改制後首任校長。五十四年設夜間部，招收普師畢業之現任教師進修。五十五年，戴氏請辭，教育聽改派廖傳准先生繼任；五十八年九月，何讓先生接任校長，建樹良多。六十九年八月，何校長退休，鮑家驄先生接任，鮑校長承歷任校長慘淡經營之餘緒，更銳意革新，積極改進校務，重新規劃校區、加強學校建設、提高師資水準、強化各科教學、加強小學輔導、建立國際合作關係，以增進教學校果，提昇教育水準。

民國七十六年七月一日，本校奉令改制為師範學院，設初等教育學系、語文教育學系、數理教育學系與社會科教育學系，並且附設二年至幼兒教育師資科。原校長鮑家驄先生奉聘為首任院長。民國七十七年七月，本校提供國小教師進修機會，成立進修部，同年即行招生，並配合師資多元化發展之目標，協助東部紓解小學師資不足之困境，辦理國小師資及代課教師進修班。七十九年八月一日，鮑校長退休，陳迺臣先生接任校長，賡續培養國民小學及學前教育優秀師資。民國八十二年十一月，陳迺臣院長任期屆滿，本校為落實校園民主之精神，陳伯璋先生經由遴選程序出任校長，首開師範學院校長遴選風氣之先。八十九年十月劉錫麒校長接任校務，就任以來，致力推動校務，期能因應教育鼎革時潮，開啟師範教育之新局。

民國九十三年八月一日，林煥祥先生接任創校以來第十三任校長，此時師範院校正面臨轉型的挑戰，林校長以積極的態度，本著「珍惜人文鄉土好傳統，開創國際視野新契機」的願景推動校務，期望能將花師由優良的傳統帶向美好的未來。

本校創立至今，畢業學生現身國民教育者，遍布各地，咸能敬業樂道，對於吾國之國民教育，貢獻殊大。其在學術、藝術、運動著有成就，蜚聲國際者，亦所在多有。此不僅為歷任校長領導策劃之功，亦歷任教職員工奉獻心力之成果。本校遷校之初，衡諸他校，校地尚稱開闊，復蒙政府撥款，增建校舍，充實設備，英才作育，實可立待。惟比年以來，良師需求日切，學生人數日增，瞻望未來，目前格局，實感不足，刻正協調各方，積極訪求第二校區，再創猷新。